技术简介

CETSA+MS(细胞热迁移-质谱联用技术)由Molina等于2013年首次提出,巧妙利用"配体结合后靶蛋白热稳定性发生改变"的基本物理化学原理,在完整活细胞中直接验证药物与靶蛋白的结合。

当小分子与靶蛋白结合后,形成的蛋白-配体复合物构象更加稳定,其热变性温度(Tm)会发生上移(热稳定性增强)或下移(热稳定性减弱)。通过梯度加热处理,结合质谱进行全蛋白质组范围的高通量检测,CETSA+MS可在不进行任何化学修饰的前提下,在活细胞中原位识别药物结合靶点,并评估其结合强度。

CETSA+MS技术简介

技术原理

当小分子配体与其靶蛋白特异性结合后,会通过疏水作用、氢键及静电相互作用诱导靶蛋白发生构象紧缩或重排,形成热力学上更稳定的蛋白-配体复合物。这种构象稳定性的变化直接表现为靶蛋白的热变性温度(Tm)发生偏移——通常表现为上移(热稳定性增强),少数情况也可表现为下移(热稳定性减弱)。传统热漂移分析(TSA)通常使用纯化蛋白在体外进行,而CETSA将其拓展至复杂细胞体系,进一步将检测维度从单蛋白扩展到全蛋白质组。

技术原理图

核心优势

🧬

活细胞原位

在完整活细胞中检测,保留真实生理环境

🚫

无需修饰

直接作用于原始药物,避免标记影响

📊

全蛋白质组

单次实验监测数千种蛋白的热稳定性变化

直接证据

提供药物与靶蛋白在细胞内的物理结合证据

🔍

区分直接/间接

热稳定性偏移可辅助区分直接靶点与下游通路

⚠️

脱靶评估

同时鉴定非预期结合蛋白,预测毒副作用

应用场景

💊

药物直接靶点活细胞验证

在生理条件下验证药物与靶蛋白的直接结合

🌿

天然产物/中药活性成分靶点发现

无标记筛选复杂天然产物的直接作用靶点

🎯

表型筛选化合物的靶点反卷积

从表型效应回溯分子层面的作用靶点

🔬

药物脱靶效应与选择性评价

评估药物的选择性,发现潜在脱靶风险

🔄

药物重定位

发现已上市药物的新靶点和新适应症

研究案例

CETSA‑MS unveils novel targets engaged by rigosertib to promote anti‑tumor activity and inflammatory responses

期刊:iScience (Cell Press) DOI:10.1016/j.isci.2025.112748

研究背景与挑战

临床痛点:Rigosertib(RGS,ON‑01910.Na)是一种多激酶抑制剂,已进入晚期鳞状细胞癌(RDEB‑associated SCC)的2期临床以及与帕博利珠单抗联合治疗转移性黑色素瘤的2期临床试验。然而,其确切的抗肿瘤作用机制一直不明确,阻碍了临床适应症的进一步拓展。

科学问题:Rigosertib是否通过与细胞内的特定蛋白直接结合而发挥抗肿瘤作用?其结合靶点是什么?这些靶点如何介导抗肿瘤活性和炎症反应?

CETSA+MS技术应用

研究团队采用CETSA+MS(细胞热漂移分析‑质谱联用技术)进行全蛋白质组的无偏靶点筛选:

全局性靶点筛选:在完整活细胞中处理Rigosertib,通过梯度加热使未结合药物的蛋白变性沉淀,结合药物的靶蛋白因热稳定性增强而保持可溶。利用高分辨质谱对可溶蛋白进行全蛋白质组鉴定与定量。

锁定全新靶点:CETSA+MS技术成功鉴定出ERO1A(内质网氧化还原酶1α)和NQO2(NAD(P)H:醌氧化还原酶2)两个此前未知的Rigosertib直接作用靶点。

机制验证:实验证实,Rigosertib与ERO1A和NQO2结合后,通过诱导活性氧(ROS)产生,激活JNK信号通路,从而发挥对RAS‑MAPK信号通路的抑制作用。

主要研究发现

首次鉴定出ERO1A和NQO2为Rigosertib的直接作用靶点,为其长期未知的作用机制提供了清晰的分子解释。Rigosertib通过靶向ERO1A和NQO2,诱导ROS依赖性JNK激活,从而抑制RAS‑MAPK信号通路;同时可诱导caspase‑1活化和gasdermin裂解,激活NLRP3炎症小体依赖的炎症反应。

研究案例图