技术简介
CETSA+MS(细胞热迁移-质谱联用技术)由Molina等于2013年首次提出,巧妙利用"配体结合后靶蛋白热稳定性发生改变"的基本物理化学原理,在完整活细胞中直接验证药物与靶蛋白的结合。
当小分子与靶蛋白结合后,形成的蛋白-配体复合物构象更加稳定,其热变性温度(Tm)会发生上移(热稳定性增强)或下移(热稳定性减弱)。通过梯度加热处理,结合质谱进行全蛋白质组范围的高通量检测,CETSA+MS可在不进行任何化学修饰的前提下,在活细胞中原位识别药物结合靶点,并评估其结合强度。
技术原理
当小分子配体与其靶蛋白特异性结合后,会通过疏水作用、氢键及静电相互作用诱导靶蛋白发生构象紧缩或重排,形成热力学上更稳定的蛋白-配体复合物。这种构象稳定性的变化直接表现为靶蛋白的热变性温度(Tm)发生偏移——通常表现为上移(热稳定性增强),少数情况也可表现为下移(热稳定性减弱)。传统热漂移分析(TSA)通常使用纯化蛋白在体外进行,而CETSA将其拓展至复杂细胞体系,进一步将检测维度从单蛋白扩展到全蛋白质组。
核心优势
活细胞原位
在完整活细胞中检测,保留真实生理环境
无需修饰
直接作用于原始药物,避免标记影响
全蛋白质组
单次实验监测数千种蛋白的热稳定性变化
直接证据
提供药物与靶蛋白在细胞内的物理结合证据
区分直接/间接
热稳定性偏移可辅助区分直接靶点与下游通路
脱靶评估
同时鉴定非预期结合蛋白,预测毒副作用
应用场景
药物直接靶点活细胞验证
在生理条件下验证药物与靶蛋白的直接结合
天然产物/中药活性成分靶点发现
无标记筛选复杂天然产物的直接作用靶点
表型筛选化合物的靶点反卷积
从表型效应回溯分子层面的作用靶点
药物脱靶效应与选择性评价
评估药物的选择性,发现潜在脱靶风险
药物重定位
发现已上市药物的新靶点和新适应症
研究案例
CETSA‑MS unveils novel targets engaged by rigosertib to promote anti‑tumor activity and inflammatory responses
研究背景与挑战
临床痛点:Rigosertib(RGS,ON‑01910.Na)是一种多激酶抑制剂,已进入晚期鳞状细胞癌(RDEB‑associated SCC)的2期临床以及与帕博利珠单抗联合治疗转移性黑色素瘤的2期临床试验。然而,其确切的抗肿瘤作用机制一直不明确,阻碍了临床适应症的进一步拓展。
科学问题:Rigosertib是否通过与细胞内的特定蛋白直接结合而发挥抗肿瘤作用?其结合靶点是什么?这些靶点如何介导抗肿瘤活性和炎症反应?
CETSA+MS技术应用
研究团队采用CETSA+MS(细胞热漂移分析‑质谱联用技术)进行全蛋白质组的无偏靶点筛选:
• 全局性靶点筛选:在完整活细胞中处理Rigosertib,通过梯度加热使未结合药物的蛋白变性沉淀,结合药物的靶蛋白因热稳定性增强而保持可溶。利用高分辨质谱对可溶蛋白进行全蛋白质组鉴定与定量。
• 锁定全新靶点:CETSA+MS技术成功鉴定出ERO1A(内质网氧化还原酶1α)和NQO2(NAD(P)H:醌氧化还原酶2)两个此前未知的Rigosertib直接作用靶点。
• 机制验证:实验证实,Rigosertib与ERO1A和NQO2结合后,通过诱导活性氧(ROS)产生,激活JNK信号通路,从而发挥对RAS‑MAPK信号通路的抑制作用。
主要研究发现
首次鉴定出ERO1A和NQO2为Rigosertib的直接作用靶点,为其长期未知的作用机制提供了清晰的分子解释。Rigosertib通过靶向ERO1A和NQO2,诱导ROS依赖性JNK激活,从而抑制RAS‑MAPK信号通路;同时可诱导caspase‑1活化和gasdermin裂解,激活NLRP3炎症小体依赖的炎症反应。