技术简介

小分子药物的作用机制解析和靶点发现,一直是药物研发的核心瓶颈。传统方法往往需要对药物进行化学修饰(如生物素标记),这一过程不仅耗时耗力,还可能改变药物的天然构象与活性,导致假阳性或漏筛。

DARTS+MS(药物亲和反应靶点稳定性-质谱联用技术)是一种无标记、无偏向性的靶点筛选技术,由 Lomenick 等于 2009 年首次提出。该技术巧妙利用小分子与靶蛋白结合后改变蛋白稳定性的原理,直接在细胞裂解液或活细胞体系中"钓取"靶点,结合高分辨质谱(LC-MS/MS)完成靶蛋白的鉴定与定量分析。

DARTS+MS 的核心价值在于:无需对药物进行任何结构修饰,即可在天然状态下高效筛选小分子药物的直接作用靶点,尤其适用于结构复杂、修饰困难的天然产物及活性化合物的机制研究。

DARTS+MS技术简介

技术原理

DARTS 技术的原理源于一个基本的生物学现象:当小分子配体与靶蛋白特异性结合后,会通过疏水作用、氢键及静电相互作用等非共价作用力,诱导靶蛋白发生构象变化,形成热力学上更稳定的蛋白-配体复合物。这种构象稳定性显著增强了靶蛋白对广谱蛋白酶(如蛋白酶K、胰蛋白酶)的抵抗能力,水解程度相较于未结合小分子的蛋白大幅降低。通过SDS-PAGE分离,进行实验组和对照组的条带比较,最后进行质谱鉴定,即可得到小分子的潜在靶点蛋白。

技术原理图

核心优势

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无需修饰

直接作用于原始药物,避免标记影响活性与构象

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普适性强

适用激动剂、拮抗剂、共价抑制剂等多种小分子

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近生理条件

可在细胞裂解液或活细胞中进行,结果更真实

操作简便

流程短、成本低、无需特殊设备

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天然产物友好

尤其适合中药等复杂成分的靶点鉴定

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数据可回溯

一次实验获得全蛋白组候选靶点,支持反复挖掘

应用场景

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中药活性成分靶点发现

适用于复杂天然产物的直接靶点筛选

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小分子药物作用机制研究

解析药物分子层面的作用靶点与通路

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药物脱靶效应与毒理学评价

发现潜在脱靶蛋白,评估药物安全性

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先导化合物靶点早期筛选

快速锁定候选药物的潜在靶点

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老药新用 / 药物重定位

发现已上市药物的新适应症靶点

与SPR、CETSA等正交验证

多技术联用提高靶点确证可信度

研究案例

案例一:新白叶藤碱衍生物Z24靶向Bcthi4的抗真菌机制研究

期刊:Science Advances (2025) 影响因子:13.6

研究背景与挑战

科学问题:植物病原真菌引起的病害严重威胁农作物产量和食品安全,开发新型、低毒、高选择性的抗真菌药物迫在眉睫。新白叶藤碱衍生物Z24具有良好的抗植物病原真菌活性,但其直接作用靶点尚不明确。

DARTS-MS等多项技术联用

研究团队以Z24为分子探针,综合运用DARTS-MS、SPR、CETSA及分子对接技术进行靶点发现与验证:

靶点钓取:在真菌总蛋白裂解液中开展DARTS-MS实验,通过SDS-PAGE分离差异蛋白条带,并经质谱鉴定,成功锁定候选靶蛋白Bcthi4。

结合模式预测:分子对接模拟显示Z24与Bcthi4的结合能为-8.185 kcal/mol,提示存在强相互作用。

亲和力验证:SPR技术测定Z24与Bcthi4的平衡解离常数KD值为94.25 μM,证实二者直接结合。

主要研究发现

本研究首次鉴定出Bcthi4为Z24的直接作用靶点,并建立了"DARTS初筛 → 分子对接/SPR/CETSA多维度验证"的完整靶点确证体系。

DARTS+MS研究案例

案例二:人参皂苷治疗轻度认知障碍的靶点发现与机制研究

期刊:Journal of Ginseng Research (2021) 影响因子:6.8

研究背景与挑战

临床痛点:轻度认知障碍(MCI)是阿尔茨海默病等神经退行性疾病的早期阶段,目前缺乏有效的干预手段。人参皂苷作为传统中药的活性成分,具有改善认知功能的潜力,但其直接作用靶点及分子机制尚不清晰。

DARTS+MS与网络药理学联合分析

研究团队采用DARTS+MS无标记靶点筛选技术,结合网络药理学、分子对接及细胞功能实验,系统解析人参皂苷的作用机制:

DARTS-MS筛选:从脑组织中钓取人参皂苷的候选蛋白靶点,共鉴定出349个相关蛋白。

网络药理学分析:通过数据库收集到2,526个MCI相关治疗靶点。

交集分析:取二者重叠的81个基因进行PPI网络构建和GO/KEGG富集分析,结果提示线粒体功能在人参皂苷介导的MCI药效中起核心作用。

主要研究发现

本研究成功鉴定了人参皂苷的候选蛋白靶点,揭示了其可能通过靶向呼吸链复合物、调节线粒体功能来缓解认知障碍的全新机制。

研究案例图2